日本哪个大学数学最好？
这个题目很广，我回答一下关于理论数学方面的情况吧。 首先，作为世界上数学人才储备最多的国家，毫无疑问是日本，其次才是美俄中韩等。（很多答主列出的学校都是理工科很强的学校，而理、工、农、医这些学科用的数学其实非常不同，因此数学好的学校不一定在这些学科也非常强）
作为一个在东京大学呆过4年，京都大学呆过2年的学渣，可以负责的说，除却个别老师外，绝大多数的老师讲课都是很浅显的，跟国内大学完全没法比。举个例子来说明日本的学术水准：京都大学的量子场论老师，讲完苏子杰《量子力学》以后，会给你布置阅读文献的任务，文献数量和质量都非常高。比如，费曼路径积分这门课，老师会给你一个费曼图列表，让你自己去看文献，了解具体怎么计算。而国内大部分学校的物理系本科，就算能学到这么难的课了，老师也会直接把结论告诉你的。所以说，除了少数几个超级大牛教授以外（这些人一般都有很高的国际论文索引），其他老师的授课质量都只能算一般。
那么说到大牛教授，日本还是有非常多的优秀教授的，这里列举几个我所知晓的教过我的或者同门的教员。
1.神林和真，东京大学教授，拓扑学方面的专家，当年著名的Toda Conjecture的发现者之一，后来证明了这个猜侧。另外，他给本科生开设的复变函数这门课，深入浅出，很受学生欢迎。
2.山岸让治，京都大学教授，数论方面的专家，曾经作为交换学者在北京大学待过好几年。他的整数理论这门课，难度高，讲得很好。
3.内海光雄，东京大学准教授，数学分析方面的专家。为人非常nice，上课深入浅出，幽默风趣。
4.小林正康，京都大学教授，拓扑学方面的专家，非常有创造性的一个老师。
5.荒川俊余，东京大学本科数学最年轻的教授，微分几何与代数几何方面的专家；为人也非常nice。上面这些人，都是我耳闻目睹过的，确实是非常优秀的教授。还有田中义仁（拓扑学），清水博幸（代数几何、复变函数）等人也是公认的优秀教授。